Das Hotel Sainthill Nagasaki liegt lediglich 1 Kilometer von der Insel Dejima und nur 6 Gehminuten vom Kōfuku-ji Tempel entfernt.

Das Hotel liegt in rund 2 km Entfernung vom Berg Inasa und in rund 1 km Entfernung vom Bahnhof Nagasaki. Kulturelle Sehenswürdigkeiten in der Umgebung sind das Atombombenmuseum (2,1 km) und das Digitalmuseum von Gunkanjima (2,2 km). Das Sainthill liegt in etwa 25 Gehminuten Entfernung von der Basilika der 26 Heiligen Märtyrer Japans. Das Hotel liegt in 450 Metern von der Megane-Brücke und in 350 Metern von der Bushaltestelle Nagasaki Station South Entrance entfernt.

Die Unterkunft empfängt seine Gäste in 8 Zimmern, die mit einer Klimaanlage sowie einem Flachbildfernseher mit Satellitenkanälen ausgestattet sind. Neben einer getrennten Toilette und einer Dusche gehören auch ein Haartrockner und Handtücher zur Ausstattung des Badezimmers.

Das Restaurant Tsukemen Yochan ist nur wenige Schritte entfernt vom Hotel Sainthill Nagasaki gelegen.